「申請農業用地作農業設施容許使用審查辦法」（以下簡稱容許辦法），將再生能源發展條例所定太陽能、風力及非抽蓄式水力設施，定義為綠能設施，納入容許辦法予以規範，允許在不影響農業經營之前提下，於農業設施屋頂或農地上設置。

1. 營農屋頂型綠能設施（第28條）：經取得農業設施容許使用許可並具農業生產經營事實之農業設施，其屋頂可依容許辦法規定，檢附農業經營實績之證明文件，向土地所在之直轄市、縣（市）主管機關提出附屬設置綠能設施之申請。

2. 營農地面型綠能設施（第29條）：於直轄市、縣（市）主管機關所定推動農業經營結合綠能之專案計畫範圍內，並符合其計畫措施者，可依容許辦法第4條規定，填具申請書並檢附相關文件，於經營計畫敘明農業經營與綠能設施之結合情形，向土地所在地之直轄市、縣（市）主管機關提出申請。

3. 非營農型綠能設施（第30條）：符合特定區位及條件者，經營計畫應敘明下列事項，並依第4條規定，向土地所在地之直轄市、縣（市）主管機關提出：

（1）設置目的。

（2）興建設施之基地地號及興建面積。

（3）計畫構想：包括計畫期程、設施之總裝置電容量、遮蔽率、植被覆蓋管理及工程設計等內容，以及申請人非土地所有權人者，並應說明對土地所有權人之經濟助益，並檢附土地使用權利證明文件等文件。

1. 營農屋頂型綠能設施（第28條）：農業設施屋頂附屬綠能設施：除容許辦法第13條附表一之規定，網室不得附屬設置綠能設施，及溫室及植物環控栽培不得超過屋頂面積40%外，其餘領有建築執照之室內水產養殖設施、畜牧設施等建築物得依法申設綠能設施，惟須依農業經營計畫內容確實做農業使用，且綠能設施不得影響農業設施內之動植物生長。

2. 營農地面型綠能設施（第29條）：依據容許辦法第7條之規定，設施總面積不得超過申請設施所坐落之農業用地土地面積40%。

3. 非營農型綠能設施（第30條）：依據容許辦法第30條，設施總面積不得超過申請設施所坐落之農業用地土地面積70%。

依據本部104年8月25日農企字第1040012614號函說明，有關查核申請案件是否符合原核定計畫內容使用之審認，農業主管機關得以申請人所提經營計畫之栽種作物，依農業統計年報該等作物近三年產量平均值之7成估認最低生產量，作為合理農業經營事實之判定參考。